29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3536 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  49.85 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  50.15 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  44.37 
 
 		 329 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  42.22 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  44.34 
 
 		 386 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  46.93 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  44.34 
 
 		 414 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  44.34 
 
 		 389 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  41.9 
 
 		 358 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  43.08 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  43.86 
 
 		 317 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  46.35 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  41.72 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  40.73 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  41.55 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  39.01 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  37.94 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  42.76 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  34.81 
 
 		 347 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  30.97 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  32.27 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  29.55 
 
 		 515 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  31.83 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  39.74 
 
 		 225 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  30.54 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  23.19 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  25.46 
 
 		 478 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.29692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>