44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1719 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1719    100 
 
 		 473 bp  938    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  85.86 
 
 		 855 bp  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  85.86 
 
 		 855 bp  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  85.86 
 
 		 855 bp  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  85.86 
 
 		 855 bp  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  83.67 
 
 		 852 bp  254  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0115  ISBt3 transposase subunit protein  90.48 
 
 		 336 bp  180  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35522  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  85.64 
 
 		 849 bp  163  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  85.64 
 
 		 849 bp  163  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2037  transposase subunit; putative  92.98 
 
 		 279 bp  163  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  80.33 
 
 		 858 bp  139  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  80.33 
 
 		 858 bp  139  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  80.33 
 
 		 858 bp  139  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  80.33 
 
 		 858 bp  139  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  80.33 
 
 		 858 bp  139  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  86.21 
 
 		 912 bp  129  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0119  transposase subunit; putative  84.04 
 
 		 339 bp  129  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0827163  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  85.92 
 
 		 915 bp  123  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6153    91.3 
 
 		 327 bp  119  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    85.21 
 
 		 916 bp  115  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  84.56 
 
 		 849 bp  113  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  84.56 
 
 		 849 bp  113  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  87.88 
 
 		 552 bp  101  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  83.8 
 
 		 852 bp  99.6  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    83.1 
 
 		 912 bp  91.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2492    85.85 
 
 		 565 bp  91.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0258476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  84.17 
 
 		 906 bp  87.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  84.17 
 
 		 906 bp  87.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  84.91 
 
 		 915 bp  83.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  82.24 
 
 		 915 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  84.81 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  90 
 
 		 906 bp  60  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  90 
 
 		 906 bp  60  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  87.1 
 
 		 900 bp  60  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  87.1 
 
 		 900 bp  60  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  86.15 
 
 		 558 bp  58  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1263  transposase subunit; putative  87.5 
 
 		 165 bp  56  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  80.83 
 
 		 300 bp  56  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1337  integrase, catalytic region  87.27 
 
 		 120 bp  54  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8255  transposase  83.33 
 
 		 369 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0325797  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  82.02 
 
 		 906 bp  50.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  82.02 
 
 		 906 bp  50.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6152    84.38 
 
 		 249 bp  48.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1309    85.71 
 
 		 165 bp  48.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>