82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4079 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  100 
 
 		 123 aa  249  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  100 
 
 		 123 aa  249  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  99.19 
 
 		 123 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  96.75 
 
 		 123 aa  241  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  88.62 
 
 		 123 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  87.8 
 
 		 123 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  89.43 
 
 		 123 aa  223  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  67.48 
 
 		 123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  67.48 
 
 		 152 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  66.67 
 
 		 243 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  66.67 
 
 		 243 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  58.2 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  45.67 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  42.62 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  45.53 
 
 		 128 aa  95.9  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  41.8 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  46.28 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  47.11 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  45.83 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  40.65 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  41.27 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  40.16 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  45 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  42.62 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  42.11 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  41.59 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  40.32 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  39.52 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  41.94 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  42.48 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  40.32 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  40.32 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  40.62 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  40.32 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  40.32 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  39.52 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  41.13 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  38.89 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  40.32 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  38.71 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  41.13 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  40.62 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  40.62 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  40.62 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  37.5 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  37.6 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  40.34 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  39.13 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  41.94 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  36.89 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  46.46 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  41.94 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  40.32 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  39.52 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  41.32 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  41.32 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  38.79 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  31.75 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  37.72 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  39.83 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  34.23 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  34.23 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  33.91 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  40.59 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  35.11 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  37.72 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  33.86 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  34.15 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  34.15 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  30.85 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  26.02 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  32.22 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  30.53 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  27.43 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  26.55 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  25.81 
 
 		 130 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>