53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3961 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3961  von Willebrand factor type A  100 
 
 
399 aa  784    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  51.36 
 
 
341 aa  282  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  45.05 
 
 
331 aa  252  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  42.14 
 
 
332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3079  von Willebrand factor type A  44.54 
 
 
364 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0708582  hitchhiker  0.000000341622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  42 
 
 
317 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2370  von Willebrand factor, type A  37.24 
 
 
336 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  27.48 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1985  hypothetical protein  28.75 
 
 
343 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0043  hypothetical protein  31.18 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  23.26 
 
 
346 aa  67  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  31.48 
 
 
334 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  29.95 
 
 
335 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.18 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  24.82 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  25.68 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  23.5 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  26.09 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  22.84 
 
 
335 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  24.36 
 
 
332 aa  53.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  30.15 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0875  hypothetical protein  31.06 
 
 
302 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134729  normal  0.367408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  23.71 
 
 
320 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  23.21 
 
 
320 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  23.1 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  20.71 
 
 
351 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 
339 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  26.48 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 
347 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  24.9 
 
 
334 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 
345 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  28.5 
 
 
352 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  23.02 
 
 
327 aa  47  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  24.66 
 
 
339 aa  47  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30.28 
 
 
412 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  28.86 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  25.09 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  25.09 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27.07 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  22.33 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  22.49 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  24.65 
 
 
352 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.72 
 
 
358 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  26.13 
 
 
585 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.44 
 
 
318 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  20.85 
 
 
329 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 
339 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 
358 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>