242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2294 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2294  periplasmic binding protein  100 
 
 
330 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30480  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  56.55 
 
 
332 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178307  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  48.23 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  45.03 
 
 
316 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  41.99 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  39.49 
 
 
335 aa  215  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3055  periplasmic binding protein  43.3 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  35.84 
 
 
351 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.82 
 
 
324 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.82 
 
 
324 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.49 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.49 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.49 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.49 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  33.56 
 
 
352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  29.81 
 
 
324 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  30.18 
 
 
300 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  33.71 
 
 
312 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
309 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  30.25 
 
 
309 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  29.72 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3977  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.43 
 
 
302 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00151  iron-hydroxamate transporter subunit  26.84 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000912024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00150  hypothetical protein  26.84 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000817605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0162  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.27 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0144  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.47 
 
 
296 aa  96.3  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  28.04 
 
 
317 aa  95.9  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0210  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.91 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3450  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202781  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0211  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.91 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.911967 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.21 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0157  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.91 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0156  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.91 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3507  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.91 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000933155  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0164  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.91 
 
 
296 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0226  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.74 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0222  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.91 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0229  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.91 
 
 
296 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  30.66 
 
 
308 aa  92.8  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2782  periplasmic binding protein  32.33 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50340  iron(III)-siderophore-binding periplasmic protein  30.8 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3461  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  28.06 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0997  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  28.06 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2813  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.07 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  25.84 
 
 
308 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3332  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  28.06 
 
 
303 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  30.03 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  24.84 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3108  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.28 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0754  FecB protein  22.1 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.036257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0088  periplasmic binding protein  29.79 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0692  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.17 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40073  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1439  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, periplasmic siderophore binding protein  30.36 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0617961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  24.23 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  27.86 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1305  periplasmic binding protein  27.56 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
662 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  26.35 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.64 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  25.81 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  27.47 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1170  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.65 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  23.23 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  29.5 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1009  periplasmic binding protein  24.1 
 
 
295 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6475  periplasmic binding protein  24.81 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  24.54 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  25.78 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4802  periplasmic binding protein  25 
 
 
277 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003569  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  24.52 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  20.86 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1140  periplasmic binding protein  24.82 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.7 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.64 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.36 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.36 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.69 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  24.18 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3580  ABC transporter substrate binding protein (ferrichrome)  23.37 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  23.46 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.74 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.69 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2083  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.72 
 
 
429 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  22.74 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  22.11 
 
 
317 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1937  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.72 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189462  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  25.51 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  25.51 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  25 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1628  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.72 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0291  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.72 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0870  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.72 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3767  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0570173 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1185  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.72 
 
 
342 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>