59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1948 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
293 aa  559  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  49.64 
 
 
287 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  52.17 
 
 
323 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  52.55 
 
 
298 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  43.64 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  43.51 
 
 
329 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  44.81 
 
 
303 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  44.4 
 
 
303 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  40.51 
 
 
299 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  42.01 
 
 
300 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  39.86 
 
 
310 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  42.12 
 
 
300 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  38.01 
 
 
293 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  41.38 
 
 
299 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  41.76 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  45.11 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  39.31 
 
 
474 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  36.6 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  48.11 
 
 
305 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  39.19 
 
 
315 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
296 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  41.79 
 
 
299 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  36.23 
 
 
292 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  36.23 
 
 
292 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  35.47 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 
291 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  34.83 
 
 
293 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 
303 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  34.83 
 
 
292 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  34.96 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  42.7 
 
 
305 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  35.23 
 
 
534 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  37.97 
 
 
299 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  41.09 
 
 
319 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  38.99 
 
 
339 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  42.16 
 
 
301 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 
293 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  41.76 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  32.76 
 
 
297 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.36 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  28.63 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  50 
 
 
838 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  36.05 
 
 
213 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0130  aminoglycoside phosphotransferase  51.02 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.670297  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0845  phosphotransferase  49.21 
 
 
74 aa  45.8  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.515192  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4256  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2900  aminoglycoside phosphotransferase  30.91 
 
 
386 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123406  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 
344 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1153  ABC-1 domain protein  30.53 
 
 
511 aa  42.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 
344 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3085  aminoglycoside phosphotransferase  42.42 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  0.971754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  32.35 
 
 
558 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>