22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1225 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
302 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  41.72 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  35.17 
 
 
304 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 
256 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  33.78 
 
 
295 aa  149  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  29.47 
 
 
310 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  32.37 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  32.43 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  32.08 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
314 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  30.22 
 
 
303 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  29.02 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  27.12 
 
 
301 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
324 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  24.75 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  24.14 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  29.65 
 
 
306 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3218  hypothetical protein  31.64 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  35.04 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  31.98 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>