More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6602 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
358 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  84.72 
 
 
360 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  88.06 
 
 
360 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.23 
 
 
359 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  51.8 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  36.76 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
260 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 
246 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 
282 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.11 
 
 
276 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6265  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
280 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0454468  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.74 
 
 
284 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  30.22 
 
 
315 aa  92.8  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  32.82 
 
 
262 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  27.48 
 
 
261 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 
264 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 
259 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.83 
 
 
265 aa  89.4  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  34.69 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  28.68 
 
 
305 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  29.71 
 
 
268 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
264 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 
258 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 
265 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  28.11 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.89 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.65 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  30.85 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  33.17 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  33.16 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  28.11 
 
 
259 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.28 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.87 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  28.99 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  24.57 
 
 
250 aa  82  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.6 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  32.28 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  29.31 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.45 
 
 
278 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
267 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  32.28 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  32.28 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  30.65 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.6 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  29.11 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  27.82 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.19 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  32.12 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  32.3 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.3 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  30.69 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  29.59 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  28.77 
 
 
258 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  28.15 
 
 
263 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  28.45 
 
 
265 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
255 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 
260 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  28.99 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.1 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  27.9 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.39 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.8 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.21 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  30.65 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  27.39 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  27.39 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
268 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.12 
 
 
258 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  30.1 
 
 
263 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  28.57 
 
 
262 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>