40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5732 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  100 
 
 		 281 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  96.8 
 
 		 281 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  54.41 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  54.41 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  54.41 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  54.41 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  54.41 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  54.41 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  54.41 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  45.16 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  46.54 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  52.51 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  45.77 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  42.41 
 
 		 266 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  46.62 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  43.58 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  48.54 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  51.53 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  51.53 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  51.15 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  48.36 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  38.94 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  35.05 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  40.38 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  39.27 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  44.77 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  43.41 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  43.69 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  39.59 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  36.87 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  37.19 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  37.19 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  37.19 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  38.54 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  34.02 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  33.06 
 
 		 252 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  34.02 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  31.09 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  29.66 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  32.1 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>