More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5240 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  63.43 
 
 		 541 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  58.21 
 
 		 539 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  58.67 
 
 		 541 aa  660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  55.18 
 
 		 539 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  63.64 
 
 		 540 aa  728    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  97.23 
 
 		 542 aa  1096    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.85 
 
 		 534 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  61.99 
 
 		 541 aa  720    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  67.9 
 
 		 542 aa  780    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  58.58 
 
 		 541 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  57.56 
 
 		 541 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 542 aa  1122    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  97.42 
 
 		 542 aa  1098    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  60.7 
 
 		 541 aa  697    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  61.94 
 
 		 541 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  58.58 
 
 		 539 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  61.25 
 
 		 541 aa  716    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  55.18 
 
 		 539 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  58.86 
 
 		 541 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 		 540 aa  780    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 		 539 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 		 539 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  96.68 
 
 		 569 aa  1088    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  55.84 
 
 		 545 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 542 aa  1122    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  58.77 
 
 		 541 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  97.23 
 
 		 542 aa  1096    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  62.85 
 
 		 540 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  56.9 
 
 		 546 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  58.67 
 
 		 541 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 		 536 aa  631  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  56.32 
 
 		 560 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  53.7 
 
 		 524 aa  610  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 		 526 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  57.54 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  43.5 
 
 		 588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  32.44 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.21 
 
 		 479 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.21 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.99 
 
 		 479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.99 
 
 		 479 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.99 
 
 		 479 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.99 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.99 
 
 		 479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.04 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.77 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.77 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  31.02 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.18 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  30.72 
 
 		 476 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.75 
 
 		 482 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.56 
 
 		 471 aa  225  2e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.78 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  31.08 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.06 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  29.07 
 
 		 475 aa  209  8e-53  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  30.25 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  28.41 
 
 		 477 aa  173  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  27.71 
 
 		 468 aa  169  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  27.79 
 
 		 478 aa  166  9e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  28.38 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  30.1 
 
 		 489 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  27.44 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  26.68 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  28.38 
 
 		 489 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.48 
 
 		 474 aa  160  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.48 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  28.48 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  27.39 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  27.9 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  29.33 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  27.09 
 
 		 479 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.33 
 
 		 471 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  26.83 
 
 		 449 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  27.42 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  28.47 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  25.71 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  27.96 
 
 		 475 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  28.48 
 
 		 476 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  29.73 
 
 		 535 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.8 
 
 		 482 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0367  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.05 
 
 		 522 aa  153  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.5 
 
 		 482 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  28.61 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1454  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.21 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  27.23 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  25.54 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  28.34 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3822  Aldehyde Dehydrogenase  27.31 
 
 		 518 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.959646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1729  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  26.52 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  28.19 
 
 		 505 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  27.94 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  27.81 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.76 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>