More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0367 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0367  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  100 
 
 
522 aa  1065    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0870  Aldehyde Dehydrogenase  43.08 
 
 
528 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3373  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
532 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2203  aldehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
528 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000275191  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3077  aldehyde dehydrogenase  40.69 
 
 
521 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.389832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0274  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.29 
 
 
515 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1641  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.18 
 
 
525 aa  310  5.9999999999999995e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1043  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.86 
 
 
515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0289  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.76 
 
 
515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0014  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.57 
 
 
522 aa  302  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.440333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0400  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  36.02 
 
 
531 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0290  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.56 
 
 
515 aa  299  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0338  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.76 
 
 
515 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0295  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.76 
 
 
515 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0340  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.76 
 
 
515 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0279  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.76 
 
 
515 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0282  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.76 
 
 
515 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0381  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.76 
 
 
515 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0309  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.76 
 
 
515 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4965  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.56 
 
 
515 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0355  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  35.56 
 
 
515 aa  296  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2128  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.16 
 
 
514 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2630  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.29 
 
 
514 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.968673  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2576  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.29 
 
 
514 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.48 
 
 
991 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.28 
 
 
991 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1548  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.26 
 
 
516 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3333  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.29 
 
 
521 aa  277  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000027969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.59 
 
 
991 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.93 
 
 
993 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3126  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.73 
 
 
515 aa  273  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187882  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.01 
 
 
993 aa  273  7e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1174  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.48 
 
 
525 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.40111  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0850  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.41 
 
 
523 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.154073  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1731  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.46 
 
 
514 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2305  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.06 
 
 
516 aa  264  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.639726 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0323  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.46 
 
 
516 aa  263  6.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  36.17 
 
 
493 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  35.48 
 
 
503 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  33.66 
 
 
996 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.2 
 
 
990 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  36.14 
 
 
496 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  36.49 
 
 
975 aa  257  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  35.06 
 
 
497 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.33 
 
 
1001 aa  256  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.16 
 
 
1004 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0535  Aldehyde Dehydrogenase  33.85 
 
 
528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2922  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.21 
 
 
521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4731  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.4 
 
 
517 aa  253  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
505 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.35 
 
 
1004 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  33.7 
 
 
499 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  35.87 
 
 
496 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  32.75 
 
 
498 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.36 
 
 
1001 aa  242  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0074  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.85 
 
 
530 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.9 
 
 
1004 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  35.1 
 
 
483 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4195  Aldehyde Dehydrogenase  33.14 
 
 
1025 aa  240  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.17632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  32.5 
 
 
1006 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.76 
 
 
1003 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  33.9 
 
 
478 aa  236  8e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  32.55 
 
 
480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  34.65 
 
 
493 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  34.73 
 
 
483 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  32.75 
 
 
498 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  34.89 
 
 
496 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  32.89 
 
 
480 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  32.5 
 
 
1002 aa  230  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  32.44 
 
 
1028 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  33.91 
 
 
1003 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  33.7 
 
 
485 aa  229  8e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
480 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  32.6 
 
 
490 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  31.49 
 
 
464 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  31.72 
 
 
484 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  36.34 
 
 
474 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  33.18 
 
 
498 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.87 
 
 
476 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  32.5 
 
 
1013 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 
516 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  33.04 
 
 
482 aa  223  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4012  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 
508 aa  223  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  33.73 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.44 
 
 
483 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  30.91 
 
 
495 aa  220  6e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  33.33 
 
 
505 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  31.79 
 
 
479 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1661  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.69 
 
 
1050 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  30.96 
 
 
484 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  33.81 
 
 
485 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.64 
 
 
491 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.13 
 
 
477 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1655  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.69 
 
 
1050 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  31.65 
 
 
490 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  33.02 
 
 
473 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  33.67 
 
 
507 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  32.14 
 
 
486 aa  217  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  32.77 
 
 
493 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2639  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  32.73 
 
 
515 aa  216  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>