More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4688 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  84.62 
 
 		 472 aa  793    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  98.94 
 
 		 472 aa  958    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  84.84 
 
 		 464 aa  795    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  79.03 
 
 		 468 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  84.62 
 
 		 464 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  97.03 
 
 		 470 aa  907    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  83.66 
 
 		 464 aa  766    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  98.24 
 
 		 470 aa  927    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  98.24 
 
 		 470 aa  926    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  84.84 
 
 		 472 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 472 aa  970    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  98.24 
 
 		 470 aa  926    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  84.62 
 
 		 472 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  84.84 
 
 		 464 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  94.61 
 
 		 465 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  64.68 
 
 		 452 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  64.46 
 
 		 452 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  65.14 
 
 		 457 aa  618  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  62.69 
 
 		 454 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  63.93 
 
 		 461 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  64.63 
 
 		 463 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  63.07 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  64.16 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  64.32 
 
 		 462 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  64.32 
 
 		 462 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  62.23 
 
 		 456 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  62.53 
 
 		 467 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  62.93 
 
 		 463 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  60.62 
 
 		 454 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  60 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  60.84 
 
 		 452 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  62.2 
 
 		 478 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  58.85 
 
 		 452 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  59.87 
 
 		 454 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  58.9 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  56.99 
 
 		 467 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  56.99 
 
 		 467 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  56.99 
 
 		 467 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  58.89 
 
 		 454 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  58.49 
 
 		 469 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  56.99 
 
 		 467 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  56.77 
 
 		 467 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  56.77 
 
 		 467 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  56.1 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  56.1 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  55.31 
 
 		 467 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  56.24 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  56.55 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  56.98 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  55.65 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  53.85 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  54.99 
 
 		 469 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  53.19 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  54.32 
 
 		 469 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  57.42 
 
 		 457 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  54.14 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  53.03 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  53.91 
 
 		 454 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  53.83 
 
 		 480 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  55.31 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.69 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  56.11 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  51.6 
 
 		 460 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  53.61 
 
 		 480 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  53.61 
 
 		 480 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.31 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  49.56 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  50.11 
 
 		 468 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  49.45 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.97 
 
 		 460 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  52.11 
 
 		 466 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  50.78 
 
 		 466 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  49.89 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  50.56 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  50.11 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  49.68 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  52.11 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  52.11 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  50 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  50.87 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  51.33 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  50.56 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  48.89 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  48.28 
 
 		 482 aa  435  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  46.84 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285559 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  43.11 
 
 		 486 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  46.28 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  46.14 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  39.75 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  41.47 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  47.04 
 
 		 408 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  40.79 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  42.76 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.55 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  42.55 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  43.16 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3646  putative monooxygenase, DszA family  43.82 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  40.57 
 
 		 452 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  42.76 
 
 		 493 aa  340  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3554  hypothetical protein  42.43 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>