85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1564 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  98.22 
 
 		 338 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  91.42 
 
 		 338 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  90.53 
 
 		 338 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  91.12 
 
 		 338 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  91.12 
 
 		 338 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  84.02 
 
 		 336 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  59.6 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  49.14 
 
 		 339 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  48.19 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  43.03 
 
 		 337 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  50.44 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  44.3 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  49.34 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  46.95 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  50 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  48.93 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  45.24 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  49.77 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  50.23 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  48.19 
 
 		 354 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  52.48 
 
 		 205 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  46.89 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  47.14 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  51.74 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  43.19 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  43.03 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  41.78 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  43.93 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  44.3 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  47.11 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  43.61 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  44.3 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  43.11 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  43.11 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  41.2 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  42.92 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  41.07 
 
 		 925 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  39.54 
 
 		 443 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  46.45 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  39.06 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  36.36 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  37.62 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  37.62 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  37.98 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  37.13 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  37.5 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  34.97 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  31.15 
 
 		 192 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  32.77 
 
 		 195 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  32.77 
 
 		 225 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  27.78 
 
 		 813 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  31.64 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  30.05 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.46 
 
 		 810 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  31.21 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  29.19 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  28.9 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  30.61 
 
 		 842 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  28.9 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  28.9 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  26.77 
 
 		 210 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  31.55 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  32.07 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  29.94 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  31.32 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  28.34 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.77 
 
 		 818 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  26.19 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  27.68 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  25.6 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  29.38 
 
 		 207 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  26.82 
 
 		 191 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  27.49 
 
 		 187 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  27.49 
 
 		 196 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  34.81 
 
 		 209 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  27.06 
 
 		 183 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  25.97 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  25.33 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 161 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>