More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0305 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  88.11 
 
 		 614 aa  1009    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  74.24 
 
 		 627 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  74.56 
 
 		 627 aa  838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  100 
 
 		 611 aa  1211    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  74.4 
 
 		 627 aa  836    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  74.56 
 
 		 627 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  74.56 
 
 		 627 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  92.54 
 
 		 617 aa  1075    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  74.56 
 
 		 627 aa  838    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  74.56 
 
 		 627 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  69.1 
 
 		 626 aa  864    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  73.11 
 
 		 627 aa  846    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  70.13 
 
 		 631 aa  830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  91.71 
 
 		 615 aa  1075    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  92.2 
 
 		 615 aa  1063    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  68.57 
 
 		 618 aa  811    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  99.02 
 
 		 611 aa  1200    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  91.71 
 
 		 615 aa  1075    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  49.28 
 
 		 624 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  48.26 
 
 		 649 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  50.24 
 
 		 639 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  50.17 
 
 		 608 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.58 
 
 		 586 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  49.5 
 
 		 605 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  47.24 
 
 		 623 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  48.25 
 
 		 604 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  44.05 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  41.57 
 
 		 622 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  42.25 
 
 		 625 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  41.2 
 
 		 624 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  39.94 
 
 		 632 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.37 
 
 		 810 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  38.25 
 
 		 731 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  43.41 
 
 		 752 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  41.4 
 
 		 750 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  41 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  41.62 
 
 		 623 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.51 
 
 		 789 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  41.82 
 
 		 642 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  42.03 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  42.83 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  36.12 
 
 		 630 aa  379  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  41.41 
 
 		 745 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  38.22 
 
 		 654 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.81 
 
 		 628 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  36.7 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.02 
 
 		 626 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  39.04 
 
 		 623 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  36.17 
 
 		 586 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.39 
 
 		 631 aa  347  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.15 
 
 		 616 aa  347  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.15 
 
 		 616 aa  347  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.37 
 
 		 589 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  35.47 
 
 		 575 aa  340  4e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  36.05 
 
 		 629 aa  340  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  35.73 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.85 
 
 		 610 aa  332  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  33.89 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 604 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.19 
 
 		 592 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.01 
 
 		 610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.88 
 
 		 619 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  37.24 
 
 		 603 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.5 
 
 		 628 aa  327  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.67 
 
 		 613 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.88 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.55 
 
 		 619 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.72 
 
 		 619 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  37.48 
 
 		 577 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 611 aa  323  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.54 
 
 		 608 aa  323  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.31 
 
 		 613 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.63 
 
 		 616 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.42 
 
 		 624 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.67 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.48 
 
 		 607 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.48 
 
 		 609 aa  320  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.36 
 
 		 583 aa  319  9e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.71 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.23 
 
 		 595 aa  316  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 595 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 595 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.81 
 
 		 602 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.6 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  35.39 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  33.72 
 
 		 589 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.38 
 
 		 591 aa  309  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  35.95 
 
 		 558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.98 
 
 		 563 aa  308  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35 
 
 		 604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.41 
 
 		 563 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.54 
 
 		 590 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  33.5 
 
 		 603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.92 
 
 		 614 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.28 
 
 		 592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.39 
 
 		 565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  36.63 
 
 		 600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.9 
 
 		 583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.39 
 
 		 565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.98 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>