34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1466 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  98.57 
 
 
210 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  84.44 
 
 
225 aa  293  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  52.05 
 
 
159 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  77.65 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  74.12 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  74.12 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  74.12 
 
 
165 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  74.12 
 
 
165 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  74.12 
 
 
165 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  74.39 
 
 
171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  69.41 
 
 
165 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  70.13 
 
 
165 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  39.42 
 
 
174 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  40 
 
 
174 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  37.81 
 
 
161 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  57.14 
 
 
174 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  54.76 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  30.1 
 
 
142 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  31.18 
 
 
162 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  30.85 
 
 
153 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  42.22 
 
 
147 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  42.19 
 
 
145 aa  51.6  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  29.63 
 
 
143 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  41.25 
 
 
136 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  45.28 
 
 
161 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  56.82 
 
 
158 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  33.33 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  39.51 
 
 
160 aa  41.6  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>