More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2877 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  96.51 
 
 
430 aa  809    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  96.51 
 
 
430 aa  809    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  81.38 
 
 
447 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  96.28 
 
 
430 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  100 
 
 
430 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  70.48 
 
 
421 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  71.83 
 
 
419 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  67.58 
 
 
432 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  67.75 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  67.75 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  67.75 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  67.75 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  68.46 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  66.83 
 
 
432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  67.75 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  67.5 
 
 
432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  67.75 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  67.75 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  68.46 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  68.21 
 
 
432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  67.5 
 
 
432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  68.21 
 
 
432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  68.21 
 
 
432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  66.25 
 
 
432 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.84 
 
 
461 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.61 
 
 
461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.25 
 
 
432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  63.7 
 
 
468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  52.69 
 
 
428 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  53.09 
 
 
429 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.62 
 
 
424 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  52.36 
 
 
440 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  51.51 
 
 
424 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  52.09 
 
 
427 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  51.13 
 
 
438 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.79 
 
 
429 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  51.96 
 
 
437 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  48.91 
 
 
429 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.21 
 
 
425 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48 
 
 
447 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.5 
 
 
444 aa  333  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  46.06 
 
 
391 aa  326  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  43.07 
 
 
407 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.51 
 
 
448 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  42.14 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.9 
 
 
531 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  41.95 
 
 
476 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.4 
 
 
531 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  42.99 
 
 
433 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.15 
 
 
531 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.51 
 
 
417 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.63 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.51 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.85 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.11 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  41.54 
 
 
450 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.28 
 
 
447 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.15 
 
 
415 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  41.16 
 
 
439 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  40.2 
 
 
463 aa  300  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.01 
 
 
415 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  40.87 
 
 
439 aa  299  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  42.32 
 
 
432 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.77 
 
 
447 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  41.39 
 
 
473 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  41.42 
 
 
447 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  41.22 
 
 
430 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  38.81 
 
 
438 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.92 
 
 
434 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.28 
 
 
474 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.88 
 
 
453 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.87 
 
 
439 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  42.03 
 
 
432 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.03 
 
 
432 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  42.03 
 
 
432 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.46 
 
 
454 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.78 
 
 
575 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  40.2 
 
 
439 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.76 
 
 
538 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.35 
 
 
434 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  41.55 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  41.31 
 
 
439 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.31 
 
 
426 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.31 
 
 
441 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.46 
 
 
448 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.75 
 
 
530 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  40.05 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.47 
 
 
680 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.85 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  42.01 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.17 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  42.86 
 
 
554 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.77 
 
 
537 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  39.85 
 
 
477 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  40.4 
 
 
470 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  39.79 
 
 
407 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  39.95 
 
 
712 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>