More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1642 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1642  IS30 family transposase  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  35.27 
 
 
290 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  35.27 
 
 
290 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  35.27 
 
 
290 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  37.92 
 
 
326 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 
335 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 
335 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 
335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  37.7 
 
 
385 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  37.7 
 
 
385 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 
335 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  33.47 
 
 
335 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  36.02 
 
 
317 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  36.89 
 
 
336 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  36.25 
 
 
356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  36.25 
 
 
356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 
339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 
339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  34.85 
 
 
339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  35.06 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  35.06 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  35.06 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  35.06 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 
519 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 
496 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 
519 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 
525 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
400 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 
519 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  34.35 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  34.35 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  34.35 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  36 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  34.35 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  36 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  34.35 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  34.35 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  34.35 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  36 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  36 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  36 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 
519 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  34.35 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 
519 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  36.97 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
343 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  37.5 
 
 
466 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
437 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
437 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
437 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
437 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
414 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  35.5 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  37.92 
 
 
334 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  37.92 
 
 
334 aa  128  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  33.47 
 
 
343 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  37.92 
 
 
334 aa  128  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
474 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
474 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
474 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  33.74 
 
 
342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  34.58 
 
 
342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  32.28 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  34.32 
 
 
342 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  34.09 
 
 
465 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  34.09 
 
 
453 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  30.35 
 
 
342 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 
401 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  34.11 
 
 
402 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
380 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1090  transposase  36.06 
 
 
288 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  32.22 
 
 
339 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
313 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  35.39 
 
 
333 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
313 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
313 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
313 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
313 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
313 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
313 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>