75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0821 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  100 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  48.15 
 
 
895 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  44.21 
 
 
258 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  44.21 
 
 
258 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  44.21 
 
 
258 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  36.4 
 
 
265 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  38.68 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  34.87 
 
 
266 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  38.03 
 
 
267 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  37.5 
 
 
266 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  32.94 
 
 
264 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  35.84 
 
 
258 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  37.31 
 
 
313 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.58 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  29.37 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  33.12 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.53 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.53 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.53 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.53 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.53 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  27.13 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.9 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  27.13 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  27.13 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  28.57 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.72 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  34.88 
 
 
294 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.34 
 
 
264 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.34 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  28.25 
 
 
764 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  30.19 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26.39 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  27.46 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  26.14 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.82 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  30.56 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  26.84 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.26 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  25.56 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  26.84 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  26.35 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.32 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  26.7 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.93 
 
 
811 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  30.89 
 
 
238 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28 
 
 
270 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  24.67 
 
 
265 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  26.58 
 
 
264 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  28.66 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  24.69 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.05 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  27.86 
 
 
269 aa  48.9  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  28.46 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  20 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.31 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  20 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  29.03 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.35 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.57 
 
 
267 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  28.19 
 
 
266 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  25.61 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.05 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  39.74 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.32 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0766  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.33 
 
 
213 aa  45.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.156344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  22.49 
 
 
256 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.81 
 
 
264 aa  45.4  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  30.72 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  26.77 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  24.71 
 
 
438 aa  43.9  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  36.49 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
336 aa  42.7  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.66 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>