More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B4716 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  100 
 
 
223 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  100 
 
 
223 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  97.31 
 
 
223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  98.21 
 
 
223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  98.21 
 
 
223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  98.21 
 
 
223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  97.31 
 
 
223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  97.76 
 
 
223 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  97.76 
 
 
223 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  96.41 
 
 
223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  87.44 
 
 
223 aa  421  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  61.82 
 
 
225 aa  291  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  61.36 
 
 
225 aa  291  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  61.36 
 
 
225 aa  291  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  61.36 
 
 
225 aa  290  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  60.91 
 
 
225 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  60.91 
 
 
225 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  60.91 
 
 
225 aa  289  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  61.36 
 
 
225 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  61.82 
 
 
225 aa  289  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 
225 aa  288  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  59.55 
 
 
224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  57.85 
 
 
227 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  57.85 
 
 
227 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 
226 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C61  DNA-binding response regulator  53.85 
 
 
222 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 
229 aa  201  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 
230 aa  193  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 
224 aa  184  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.69 
 
 
223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  43.24 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 
223 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 
223 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
220 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 
224 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 
225 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 
230 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 
230 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  58.87 
 
 
166 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 
237 aa  178  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 
227 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
233 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 
231 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
231 aa  175  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 
228 aa  174  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  42.01 
 
 
221 aa  174  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 
223 aa  174  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
231 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  41.1 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 
237 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 
236 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.65 
 
 
226 aa  172  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4937  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 
229 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 
231 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 
231 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4564  DNA-binding response regulator  41.48 
 
 
229 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
229 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 
228 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 
224 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
222 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  40.71 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  40.71 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.44 
 
 
227 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 
231 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 
229 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 
219 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 
225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 
225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  40.83 
 
 
219 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4646  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
229 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>