More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7817 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7817  transposase  100 
 
 		 92 aa  189  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  55.17 
 
 		 252 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  55.17 
 
 		 252 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  55.17 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  44.57 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  52.33 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  55.81 
 
 		 86 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  54.65 
 
 		 251 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  54.65 
 
 		 251 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.28 
 
 		 252 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.28 
 
 		 252 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  54.65 
 
 		 260 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  48.84 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  48.84 
 
 		 186 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  48.84 
 
 		 186 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  48.84 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  48.84 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  48.84 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  48.84 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.19 
 
 		 251 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  48.84 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  48.84 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 336 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  39.13 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  39.13 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  39.13 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  39.13 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  47.67 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  47.67 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  47.67 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  47.67 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  47.67 
 
 		 201 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  47.67 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  46.51 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  46.51 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  46.51 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  45.35 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  45.35 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  45.35 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  43.18 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  43.18 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  41.86 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  45.56 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  47.78 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  44.19 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  44.19 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  47.06 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  47.06 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  44.44 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  61.43 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  61.43 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  48.84 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  61.43 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  42.53 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  48.15 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  42.53 
 
 		 253 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  42.53 
 
 		 253 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  42.53 
 
 		 253 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  45.45 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  44.05 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  44.94 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  44.32 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  44.32 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  44.32 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  44.32 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  43.02 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  43.02 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  43.02 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  43.02 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  41.38 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  46.51 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  46.51 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  46.99 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  46.99 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>