More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6995 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6995  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1391  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  67.41 
 
 
252 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4701  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.58 
 
 
255 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  64.76 
 
 
253 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.333261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1371  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  64.44 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  69.52 
 
 
239 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1965  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  71.93 
 
 
233 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  61.75 
 
 
236 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436029  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  60.83 
 
 
354 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.098708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2488  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  62.07 
 
 
371 aa  258  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.048272  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  65.91 
 
 
406 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.453265  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  70.52 
 
 
231 aa  254  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2829  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.11 
 
 
419 aa  254  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  65.91 
 
 
410 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  66.32 
 
 
232 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2129  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  62.11 
 
 
408 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838619  normal  0.0574467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4131  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.47 
 
 
421 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6254  hypothetical protein  63.44 
 
 
405 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4672  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.59 
 
 
201 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.497967  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.2 
 
 
197 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4381  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  63.1 
 
 
197 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.1 
 
 
199 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1841  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.82 
 
 
263 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0706  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG domain-containing protein  60.61 
 
 
197 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.61 
 
 
196 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2558  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  68.06 
 
 
223 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.852048  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2781  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.36 
 
 
223 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4122  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.86 
 
 
263 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1675  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.39 
 
 
259 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.02 
 
 
210 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.420797  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.86 
 
 
283 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1336  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.48 
 
 
262 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.51 
 
 
269 aa  204  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.67 
 
 
225 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.337547  normal  0.372362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5602  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.9 
 
 
215 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31169  normal  0.82128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3329  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.96 
 
 
199 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3653  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.96 
 
 
199 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5998  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.9 
 
 
212 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765606  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.25 
 
 
187 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3529  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.96 
 
 
199 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4451  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.79 
 
 
214 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.57 
 
 
259 aa  201  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.21 
 
 
265 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.43 
 
 
209 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.644821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.87 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3901  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.31 
 
 
221 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1783  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.99 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.06 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2770  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.05 
 
 
224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36007  normal  0.0902261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.68 
 
 
215 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1564  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.92 
 
 
197 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195162  normal  0.304052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.08 
 
 
197 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3017  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  63.83 
 
 
187 aa  194  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0398  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.28 
 
 
246 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.177632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.58 
 
 
195 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116353 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5810  hypothetical protein  53.23 
 
 
266 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2647  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.18 
 
 
248 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  0.288591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0501  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.5 
 
 
249 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2873  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.18 
 
 
222 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716515  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6654  hypothetical protein  59.87 
 
 
190 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  63.83 
 
 
187 aa  191  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0540206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.14 
 
 
190 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3003  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.49 
 
 
241 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.01 
 
 
255 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.44 
 
 
190 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0165  hypothetical protein  50 
 
 
313 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.526923  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2880  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60 
 
 
240 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60 
 
 
240 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357658  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0184  hypothetical protein  50.53 
 
 
244 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0360  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  61.54 
 
 
266 aa  185  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2290  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.14 
 
 
200 aa  184  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.324793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5811  hypothetical protein  56.41 
 
 
223 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4261  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  65.65 
 
 
191 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.594128  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.34 
 
 
258 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.78 
 
 
249 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0456  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.91 
 
 
249 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.85 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6969  hypothetical protein  54.04 
 
 
219 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3879  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.33 
 
 
205 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  63.85 
 
 
193 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.08 
 
 
193 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.511369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.43 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.36 
 
 
221 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  62.6 
 
 
193 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0284288  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1269  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.26 
 
 
224 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090481  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.64 
 
 
206 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0500  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.27 
 
 
230 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2457  hypothetical protein  45.05 
 
 
226 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.19 
 
 
305 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.1 
 
 
212 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.19 
 
 
305 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.51 
 
 
249 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.92 
 
 
228 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.48 
 
 
274 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.19 
 
 
307 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.63 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.19 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.1 
 
 
160 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.59 
 
 
249 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4291  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.7 
 
 
225 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0168565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>