20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0277 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  69.8 
 
 
457 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  70.02 
 
 
475 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  907    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  47.62 
 
 
450 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  25.2 
 
 
473 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  24.93 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.26 
 
 
225 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  26.46 
 
 
217 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.07 
 
 
223 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  28.82 
 
 
222 aa  56.6  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  29.24 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  28.9 
 
 
303 aa  54.3  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  28.9 
 
 
303 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  26.7 
 
 
298 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  31.3 
 
 
338 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  26.34 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  26.01 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  29.57 
 
 
338 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.41 
 
 
334 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>