20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  51.72 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  64 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  52.04 
 
 		 224 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  50.25 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  48 
 
 		 226 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  47.52 
 
 		 226 aa  210  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  48.17 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  48.69 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  28.21 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  33.33 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0572  membrane protein-like  37.78 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 514 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.68 
 
 		 351 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  25.93 
 
 		 516 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0401  SH3 type 3 domain-containing protein  32.97 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  32.43 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  35.42 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>