100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  74.08 
 
 		 462 aa  689    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  100 
 
 		 463 aa  905    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  71.83 
 
 		 464 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  66.67 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  58.76 
 
 		 481 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  57.85 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  53.62 
 
 		 469 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  55.12 
 
 		 471 aa  504  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  54.68 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  52.94 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  49.55 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  49.55 
 
 		 459 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  47.96 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  48.98 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  50.93 
 
 		 484 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  48.41 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  53.57 
 
 		 452 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  48.83 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  46.7 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  46.49 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  47.4 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  47.36 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  49.56 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  45.51 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  44.7 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  45.51 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  45.51 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  45.3 
 
 		 479 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  45.72 
 
 		 479 aa  359  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  45.3 
 
 		 479 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  45.74 
 
 		 479 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  45.51 
 
 		 479 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  49.45 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  48.19 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  48.56 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  48.42 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  46.14 
 
 		 463 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  47.98 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  48.65 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  45.01 
 
 		 479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  44.37 
 
 		 466 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  46.47 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  46.73 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  45.39 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  47.88 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  47.88 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  47.36 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  43.52 
 
 		 465 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  47.56 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  45.09 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  45.18 
 
 		 466 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  47.44 
 
 		 495 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  46.04 
 
 		 466 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  47.14 
 
 		 467 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  47.14 
 
 		 467 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  43.66 
 
 		 478 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  46.83 
 
 		 463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  43.66 
 
 		 478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  45.81 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  46.78 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  46.78 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  47.65 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  46.8 
 
 		 467 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  45.47 
 
 		 466 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  46.8 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  46.8 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  46.8 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  46.8 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  46.8 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  46.8 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  46.58 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  46.81 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  45.41 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  44.87 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  46.67 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  46.49 
 
 		 466 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  44.27 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  57.41 
 
 		 521 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  38.74 
 
 		 431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  37.73 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  39.82 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  40.29 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  45.54 
 
 		 141 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  45.54 
 
 		 141 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  45.54 
 
 		 141 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  45.54 
 
 		 141 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  31.14 
 
 		 421 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  28.65 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  32.58 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  32.58 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  32.58 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  26.15 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  29.51 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  29.51 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  29.51 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  26.82 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  29.51 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  29.51 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  29.51 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  29.51 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>