117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10190 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  100 
 
 
469 aa  925    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  56.33 
 
 
462 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  53.45 
 
 
521 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  55.41 
 
 
461 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  52.84 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  53.39 
 
 
464 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  52.4 
 
 
471 aa  463  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  53.49 
 
 
463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  49.79 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  49.36 
 
 
469 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  47.93 
 
 
481 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  46.42 
 
 
487 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  49.69 
 
 
483 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  45.16 
 
 
485 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  45.27 
 
 
484 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  44.22 
 
 
459 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  44.44 
 
 
459 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  43.56 
 
 
489 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  43.43 
 
 
491 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  45.9 
 
 
484 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  46.68 
 
 
479 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  47.33 
 
 
452 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  45.13 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  44.51 
 
 
479 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  46.19 
 
 
463 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  45.49 
 
 
463 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  44.84 
 
 
463 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  43.78 
 
 
479 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  43.78 
 
 
479 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  43.57 
 
 
479 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  44.34 
 
 
478 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  43.57 
 
 
479 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  44.49 
 
 
479 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  44.76 
 
 
463 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  43.57 
 
 
479 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  44.76 
 
 
463 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  44.12 
 
 
478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  43.76 
 
 
465 aa  342  7e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  43.36 
 
 
479 aa  342  9e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  45.27 
 
 
463 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  44.9 
 
 
466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  44.25 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  44.67 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  43.71 
 
 
479 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  43.96 
 
 
466 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  45.12 
 
 
463 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  43.51 
 
 
466 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  45.35 
 
 
463 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  45.98 
 
 
463 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  44.57 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  44.57 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  42.67 
 
 
466 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  45.35 
 
 
461 aa  326  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  45.29 
 
 
463 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  43.52 
 
 
463 aa  319  6e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  40.43 
 
 
465 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  43.39 
 
 
466 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  43.52 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  44.2 
 
 
463 aa  312  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  43.89 
 
 
495 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  42.92 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  42.92 
 
 
467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  42.92 
 
 
467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  43.01 
 
 
463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  43.34 
 
 
467 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  42.99 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  42.99 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  43.48 
 
 
466 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  43.21 
 
 
467 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  43.21 
 
 
467 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  43.21 
 
 
467 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  43.21 
 
 
467 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  43.21 
 
 
467 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  43.21 
 
 
467 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  43.21 
 
 
467 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  42.99 
 
 
467 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  43.29 
 
 
463 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  45.19 
 
 
466 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  33.33 
 
 
431 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  33.7 
 
 
428 aa  220  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  36.79 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  38.72 
 
 
457 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  44.64 
 
 
141 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  44.64 
 
 
141 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  44.64 
 
 
141 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  44.64 
 
 
141 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  32.12 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  32.12 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  32.37 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  30.22 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  34.34 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  33.65 
 
 
452 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  33.65 
 
 
452 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  34.34 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  39.24 
 
 
448 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  39.24 
 
 
448 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  34.34 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  34.34 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  34.34 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  34.34 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>