86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2382 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  74.63 
 
 		 466 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  76.38 
 
 		 467 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  76.81 
 
 		 467 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  76.17 
 
 		 467 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  76.17 
 
 		 467 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  76.17 
 
 		 467 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  75.96 
 
 		 467 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  76.17 
 
 		 467 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  70.66 
 
 		 466 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  99.14 
 
 		 466 aa  907    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  76.55 
 
 		 466 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  76.84 
 
 		 463 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  75.97 
 
 		 463 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  76.61 
 
 		 463 aa  688    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  76.39 
 
 		 463 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  76.38 
 
 		 467 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  69.89 
 
 		 463 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  71.46 
 
 		 463 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  73.39 
 
 		 463 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  76.6 
 
 		 467 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  75.53 
 
 		 495 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  76.84 
 
 		 463 aa  691    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  76.39 
 
 		 463 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  76.17 
 
 		 467 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  90.56 
 
 		 466 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  100 
 
 		 466 aa  915    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  76.17 
 
 		 467 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  73.82 
 
 		 463 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  72.65 
 
 		 465 aa  669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  77.68 
 
 		 463 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  76.81 
 
 		 467 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  77.04 
 
 		 463 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  76.6 
 
 		 467 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  75.74 
 
 		 467 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  76.55 
 
 		 466 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  77.47 
 
 		 463 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  68.45 
 
 		 461 aa  621  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  66.88 
 
 		 463 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  66.88 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  68.82 
 
 		 463 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  67.74 
 
 		 463 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  66.38 
 
 		 466 aa  571  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  60.3 
 
 		 465 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  60.33 
 
 		 479 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  57.53 
 
 		 479 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  57.11 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  57.32 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  57.32 
 
 		 479 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  57.32 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  57.69 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  58.06 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  57.11 
 
 		 479 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  57.11 
 
 		 479 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  57.42 
 
 		 479 aa  498  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  55.23 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  57.42 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  47.16 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  43.78 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  43.42 
 
 		 469 aa  348  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  46.39 
 
 		 461 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  44.81 
 
 		 481 aa  343  5e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  44.42 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  45.76 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  42.83 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  41.07 
 
 		 521 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  41.7 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  38.62 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  38.76 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  43.64 
 
 		 469 aa  305  9.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  39.63 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  44 
 
 		 452 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  40 
 
 		 483 aa  279  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  39.51 
 
 		 485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  37.17 
 
 		 487 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  39.79 
 
 		 491 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  39.81 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  36.06 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  33.04 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  35.16 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  33.98 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  44.24 
 
 		 479 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  44.22 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  73.21 
 
 		 141 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  73.21 
 
 		 141 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  73.21 
 
 		 141 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  73.21 
 
 		 141 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>