More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7365 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  100 
 
 		 506 aa  1006    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0248  ABC transporter related  62.77 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.752958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.47 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.42 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  42.47 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.51 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.47 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43.58 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  45.58 
 
 		 502 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.58 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.19 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.72 
 
 		 497 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.19 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.99 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.74 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 507 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.19 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.74 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.57 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4140  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 		 514 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.08 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  42.17 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0139  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.51 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  43.99 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0622  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.51 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0518663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0590  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.51 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164103  normal  0.0495673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3704  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  44.4 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.33 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.68 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  42.89 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3447  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.35 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2763  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691602  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.45 
 
 		 525 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.26 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 		 516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429295  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.5 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  44.2 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.29 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  43.45 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.48 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  42.13 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.93 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  44.85 
 
 		 526 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0405  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1265  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3300  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.67 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.77 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  41.75 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 498 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.39 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.51 
 
 		 501 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3776  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  41.45 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  43.38 
 
 		 495 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3410  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0659281  normal  0.140224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  44.73 
 
 		 525 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.78 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 		 496 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  39.75 
 
 		 525 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  41.68 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.1 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.89 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  41.25 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.57 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  42.4 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0523  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  41.65 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.67 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>