117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0046 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0001  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0149399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0029  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0035  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0048  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  92.73 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309271  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0001  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0042  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0045  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0054  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2515  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2525  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000865266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2628  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2219  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000214695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2229  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2314  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0001  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0041  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0066  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000558399  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 67 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309383  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0035  tRNA-Gly  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.724762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0781  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0621969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt35  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_003295  RS02876  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313769  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_006368  lppt23  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt23  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0022  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.182348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0055  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0023  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0032  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00257148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0047  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0247506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0045  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0639484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0018  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901161  normal  0.123364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0036  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420238  normal  0.0855626 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0031  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0047  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000286041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0055  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.337308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>