35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0091 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0091  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
171 aa  347  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.337262  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.11 
 
 
182 aa  50.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  37.21 
 
 
239 aa  50.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.11 
 
 
372 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.27 
 
 
249 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
232 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  48.68 
 
 
358 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.06 
 
 
319 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.75 
 
 
629 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.26 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.03 
 
 
317 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.18 
 
 
306 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.27 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 
300 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.1 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  45.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 
266 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.48 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.08 
 
 
391 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 
508 aa  44.3  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  37.04 
 
 
229 aa  44.3  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 
198 aa  44.3  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
327 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.49 
 
 
447 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
266 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.29 
 
 
305 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.36 
 
 
323 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  35.29 
 
 
426 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.71 
 
 
379 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  31.58 
 
 
241 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.84 
 
 
280 aa  41.2  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  33.33 
 
 
228 aa  40.8  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  26.67 
 
 
292 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 
309 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>