More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2142 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  100 
 
 
147 aa  302  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  77.24 
 
 
165 aa  238  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.23 
 
 
162 aa  216  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  65.03 
 
 
156 aa  209  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.13 
 
 
154 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.13 
 
 
154 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.13 
 
 
174 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  60.84 
 
 
168 aa  169  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1262  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.26 
 
 
147 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  52.45 
 
 
150 aa  153  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.45 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  50.34 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0143  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  46.53 
 
 
155 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07751  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  46.53 
 
 
155 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal  0.0539012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.66 
 
 
166 aa  148  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16461  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  44.76 
 
 
163 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  44.9 
 
 
160 aa  147  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  48.95 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
200 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
187 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
200 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
169 aa  143  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.98 
 
 
164 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  46.15 
 
 
153 aa  142  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  48.25 
 
 
159 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  48.28 
 
 
153 aa  141  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.34 
 
 
166 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  45.89 
 
 
172 aa  140  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  48.95 
 
 
153 aa  140  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  51.02 
 
 
164 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  50.35 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.94 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.59 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.34 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.3 
 
 
168 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.25 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
168 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  46.76 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  49.66 
 
 
165 aa  136  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.15 
 
 
223 aa  136  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
172 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  47.95 
 
 
177 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.48 
 
 
155 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
167 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.62 
 
 
154 aa  135  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  48.91 
 
 
137 aa  135  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
172 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 
152 aa  135  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
178 aa  135  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  48.95 
 
 
144 aa  136  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
178 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.62 
 
 
167 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
172 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.45 
 
 
148 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  47.65 
 
 
161 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  47.62 
 
 
178 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
172 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  48.98 
 
 
182 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
178 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
172 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
167 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  47.62 
 
 
178 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  46.94 
 
 
167 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.35 
 
 
143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.58 
 
 
175 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
152 aa  134  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.58 
 
 
175 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.54 
 
 
166 aa  134  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.26 
 
 
176 aa  134  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.28 
 
 
156 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  46.26 
 
 
222 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.33 
 
 
231 aa  133  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.58 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.58 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  46.04 
 
 
177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.58 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  46.76 
 
 
182 aa  133  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
177 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  46.15 
 
 
177 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.95 
 
 
163 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.58 
 
 
174 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  49.65 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.94 
 
 
170 aa  132  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  49.31 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.32 
 
 
156 aa  131  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0882  tRNA-adenosine deaminase  43.57 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.35 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.92 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  47.62 
 
 
193 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.35 
 
 
155 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.04 
 
 
163 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.58 
 
 
158 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09411  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  42.07 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  46.76 
 
 
189 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  47.95 
 
 
165 aa  130  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.95 
 
 
165 aa  130  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
152 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.54 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>