180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1372 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  100 
 
 
307 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  68.08 
 
 
311 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  45.67 
 
 
302 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  48.45 
 
 
310 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  45.92 
 
 
310 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  47.08 
 
 
312 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6027  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  49.03 
 
 
259 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581609  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00640  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  44.18 
 
 
289 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.38 
 
 
336 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.67 
 
 
306 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.12 
 
 
287 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  44.3 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.73 
 
 
302 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  36.63 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.06 
 
 
325 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  33.66 
 
 
318 aa  188  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0953  putative D-cysteine desulfhydrase, DcyD  37.75 
 
 
314 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561188  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  32.36 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.46 
 
 
290 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2947  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  33.67 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.271855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24190  putative 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.44 
 
 
310 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0268894  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3686  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  31.45 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1569  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.44 
 
 
299 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.209686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2048  ACC deaminase/D-cysteine desulfhydrase family protein  34.2 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0600526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1676  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  32.34 
 
 
314 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334967  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1541  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  32.45 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.974247  normal  0.412213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3733  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  31.91 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3802  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  32.45 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2162  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  33.57 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0392224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2009  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  31.46 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  31.76 
 
 
312 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  31.76 
 
 
312 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  28.3 
 
 
336 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  29.18 
 
 
337 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  31.51 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  30.74 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  30.42 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  30.84 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  28.9 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  28.9 
 
 
342 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  28.9 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  28.9 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  28.9 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  28.9 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  29.77 
 
 
331 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
331 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  28.57 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  28.08 
 
 
328 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  28.08 
 
 
328 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  28.08 
 
 
328 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  28.08 
 
 
328 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  29.25 
 
 
333 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  28.95 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  28.08 
 
 
328 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  27.42 
 
 
332 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  28.05 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  28.05 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  27.97 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  28.05 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  26.4 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  29.19 
 
 
337 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  28.3 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  28.57 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2397  D-cysteine desulfhydrase  29.97 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  25.72 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  28.01 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  27.69 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  28.25 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  27.3 
 
 
330 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  29.05 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2428  D-cysteine desulfhydrase  29.07 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  26.91 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00190  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  27.86 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000288406  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0767  D-cysteine desulfhydrase  28.8 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0197666  hitchhiker  0.00499995 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  26.06 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  28.48 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5685  D-cysteine desulfhydrase  29.72 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  26.37 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  29.63 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1432  D-cysteine desulfhydrase  27.93 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.189366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  27.19 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  25.48 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  25.81 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4493  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.32 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.117981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  26.28 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  29.35 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  29.29 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.19 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0344  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.88 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>