51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2702 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 71 aa  144  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  97.18 
 
 		 71 aa  140  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  71.93 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  70.18 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  69.49 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  65 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  57.35 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  71.7 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  65.45 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  58.62 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  66.07 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  64.41 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  55.17 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  64.81 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  64.81 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  53.33 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  55.17 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  42.11 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  40.35 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  41.07 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  39.29 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  38.89 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  41.51 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  36.84 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  39.22 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  38.33 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 90 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  33.9 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  37.7 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  38.89 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 65 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>