More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1729 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 
401 aa  810    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 
412 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 
412 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  39.75 
 
 
411 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.59 
 
 
415 aa  255  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.81 
 
 
408 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  37.87 
 
 
411 aa  242  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  39.07 
 
 
413 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  34.87 
 
 
411 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  38.83 
 
 
425 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 
416 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  35.4 
 
 
420 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  34.07 
 
 
419 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.84 
 
 
424 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  34.66 
 
 
413 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.59 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  33.58 
 
 
415 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  37.06 
 
 
413 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  33.42 
 
 
412 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  35.61 
 
 
415 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  33.42 
 
 
412 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  31.27 
 
 
413 aa  203  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  32.91 
 
 
412 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  32.51 
 
 
415 aa  202  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  36.3 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  32.91 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  32.91 
 
 
412 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  32.66 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  32.66 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  31.63 
 
 
408 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.93 
 
 
431 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  31.49 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  32.01 
 
 
432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  32.66 
 
 
412 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  32.66 
 
 
412 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  31.39 
 
 
408 aa  196  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  32.1 
 
 
420 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  32.76 
 
 
417 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  31.81 
 
 
414 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.9 
 
 
408 aa  193  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.11 
 
 
430 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  35.07 
 
 
430 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  32.07 
 
 
413 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.09 
 
 
424 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  34.36 
 
 
418 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.76 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  32.45 
 
 
421 aa  190  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  32.49 
 
 
419 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  32.42 
 
 
423 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  32.3 
 
 
420 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  32.92 
 
 
416 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  31.11 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  31.34 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  32.12 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  31.34 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  32.04 
 
 
403 aa  183  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  32.6 
 
 
425 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  31.02 
 
 
418 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  31.45 
 
 
413 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  31.09 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  31.58 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  34.07 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  32.46 
 
 
415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  31.4 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.49 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  30.12 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  30.32 
 
 
416 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  31.94 
 
 
429 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  30.5 
 
 
420 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  30.1 
 
 
414 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  31.7 
 
 
401 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  30.15 
 
 
414 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  36.08 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  29.93 
 
 
433 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  29.53 
 
 
443 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  30.81 
 
 
419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.68 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  34.01 
 
 
395 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  29.28 
 
 
423 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  29.58 
 
 
418 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  29.77 
 
 
432 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  32.68 
 
 
413 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  30.64 
 
 
430 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  31.02 
 
 
424 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1344  competence/damage-inducible protein CinA  33.56 
 
 
383 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.827077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1370  competence/damage-inducible protein CinA  33.56 
 
 
383 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  29.7 
 
 
414 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  29.72 
 
 
438 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  27.82 
 
 
423 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 
425 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 
425 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  30.7 
 
 
425 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  29.75 
 
 
431 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  30.75 
 
 
424 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  30.21 
 
 
406 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  33.43 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  31.93 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  29.13 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>