More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1300 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1043  ATP synthase F1, alpha subunit  66.02 
 
 		 522 aa  708    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.890996  normal  0.113061 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1300  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 		 557 aa  1146    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21420  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  62.52 
 
 		 520 aa  672    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12070  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  66.22 
 
 		 524 aa  712    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.67 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.67 
 
 		 502 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.67 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  57.61 
 
 		 508 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  57.17 
 
 		 541 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 502 aa  598  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 502 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 502 aa  598  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 502 aa  598  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 502 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 502 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 502 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.12 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.75 
 
 		 501 aa  586  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.75 
 
 		 501 aa  588  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.56 
 
 		 509 aa  585  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  55.81 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.32 
 
 		 502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.71 
 
 		 502 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  56.12 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.74 
 
 		 502 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.53 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  55.04 
 
 		 507 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.06 
 
 		 505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.95 
 
 		 502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.53 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.53 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.58 
 
 		 507 aa  574  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.13 
 
 		 502 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.93 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  55.23 
 
 		 501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.41 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.75 
 
 		 526 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.32 
 
 		 502 aa  571  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.34 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.07 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.95 
 
 		 505 aa  569  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.34 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.98 
 
 		 506 aa  571  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  56.83 
 
 		 501 aa  568  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.75 
 
 		 502 aa  571  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.75 
 
 		 502 aa  571  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.71 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.97 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.97 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  55.34 
 
 		 501 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  55.32 
 
 		 504 aa  568  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.75 
 
 		 526 aa  567  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  53.58 
 
 		 502 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.37 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.02 
 
 		 503 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.31 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  54.56 
 
 		 508 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.23 
 
 		 503 aa  559  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.1 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.44 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.18 
 
 		 526 aa  558  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  54.14 
 
 		 507 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.93 
 
 		 526 aa  560  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.36 
 
 		 503 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.36 
 
 		 503 aa  558  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  55.41 
 
 		 509 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1978  ATP synthase F1, alpha subunit  56.5 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.07 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.77 
 
 		 500 aa  560  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.35 
 
 		 502 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.05 
 
 		 504 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.16 
 
 		 526 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  57.05 
 
 		 501 aa  557  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.68 
 
 		 505 aa  557  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.63 
 
 		 548 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.74 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.67 
 
 		 509 aa  557  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.56 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.16 
 
 		 526 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.68 
 
 		 506 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.91 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.84 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.91 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.22 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.77 
 
 		 505 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.87 
 
 		 502 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.97 
 
 		 506 aa  554  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.74 
 
 		 502 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.36 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.1 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.96 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  52.38 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.85 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.77 
 
 		 505 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.36 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.11 
 
 		 510 aa  549  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.36 
 
 		 510 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.77 
 
 		 526 aa  551  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 502 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>