More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1564 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1564  glycine cleavage H-protein  100 
 
 
248 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1642  glycine cleavage H-protein  97.18 
 
 
248 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2307  glycine cleavage H-protein  97.18 
 
 
248 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0893702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2005  glycine cleavage H-protein  67.47 
 
 
236 aa  321  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1958  glycine cleavage H-protein  68.4 
 
 
240 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1873  glycine cleavage H-protein  68 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1802  glycine cleavage H-protein  65.06 
 
 
243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0767  glycine cleavage H-protein  37.95 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2805  glycine cleavage H-protein  37.7 
 
 
300 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2945  glycine cleavage H-protein  32.68 
 
 
220 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4250  glycine cleavage H-protein  39.88 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4273  glycine cleavage H-protein  39.88 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4119  glycine cleavage H-protein  39.88 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  39.42 
 
 
132 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4278  glycine cleavage H-protein  34.52 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  35.65 
 
 
126 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  35.65 
 
 
126 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  36.89 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  36.11 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  39.05 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  35.43 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  37.98 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  36.89 
 
 
134 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 
136 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  37.21 
 
 
130 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  36.43 
 
 
127 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  37.98 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  37.14 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  37.21 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  37.14 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  40.38 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
130 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  31.5 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  32.03 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  32.56 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  37.21 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  36.19 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  36.19 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  34.88 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  36.19 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  36.64 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  39.42 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  36.19 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  36.19 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 
130 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  38.26 
 
 
127 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  38.46 
 
 
131 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  31.78 
 
 
129 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 
130 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  37.86 
 
 
126 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  35.96 
 
 
126 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  34.35 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  34.35 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 
128 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  34.35 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  35.58 
 
 
127 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  34.35 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  34.35 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  34.35 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  34.75 
 
 
142 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  34.35 
 
 
126 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  37.14 
 
 
133 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  34.75 
 
 
129 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  32.54 
 
 
131 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  35.66 
 
 
127 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  36.27 
 
 
129 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  35.65 
 
 
126 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 
127 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  35.59 
 
 
129 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  38.46 
 
 
127 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 
128 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  37.39 
 
 
127 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  34.38 
 
 
129 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  34.35 
 
 
126 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 
129 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 
129 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 
127 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  39.05 
 
 
127 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  35.24 
 
 
124 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  34.95 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  40.74 
 
 
129 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>