47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3431 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3431  putative RecX protein  100 
 
 
164 aa  288  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3513  putative RecX protein  70.44 
 
 
168 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3449  putative RecX protein  68.99 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3367  putative RecX protein  67.09 
 
 
168 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  35.67 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  38.56 
 
 
225 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  38.31 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  25.61 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.15 
 
 
206 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  35.17 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  25.33 
 
 
269 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  29.24 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  28.08 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  29.24 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  29.24 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  29.24 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  29.24 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  29.24 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  29.24 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  29.24 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  27.5 
 
 
155 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  24.84 
 
 
264 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  37.5 
 
 
207 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  27.74 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  28.99 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  22.3 
 
 
271 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  30 
 
 
271 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  26.62 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  28.57 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  28.07 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  24.05 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  29.94 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  33.1 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  33.97 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.21 
 
 
154 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  32.89 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  29.94 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  35.67 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  22.3 
 
 
210 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  26.32 
 
 
166 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  24.83 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.49 
 
 
253 aa  41.6  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  26.32 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  24.56 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  24.56 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  29.05 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  30.63 
 
 
269 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>