More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2424 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  76 
 
 
597 aa  690    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  74.46 
 
 
597 aa  694    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  75.56 
 
 
597 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 
594 aa  1119    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.89 
 
 
610 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  32.46 
 
 
601 aa  310  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.64 
 
 
607 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.76 
 
 
598 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.51 
 
 
605 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30 
 
 
626 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.16 
 
 
624 aa  287  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  31.89 
 
 
596 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  28.31 
 
 
595 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  28.31 
 
 
595 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.55 
 
 
586 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.25 
 
 
593 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.63 
 
 
590 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.67 
 
 
610 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.81 
 
 
615 aa  240  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  24.88 
 
 
601 aa  236  7e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  29.6 
 
 
590 aa  232  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.02 
 
 
618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  54.25 
 
 
243 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.62 
 
 
604 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.19 
 
 
438 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.78 
 
 
536 aa  124  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.78 
 
 
536 aa  124  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.1 
 
 
558 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  29.8 
 
 
557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.03 
 
 
554 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.06 
 
 
555 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  44.64 
 
 
112 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  35.88 
 
 
893 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.96 
 
 
443 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  25.37 
 
 
538 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  23.58 
 
 
521 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  25.55 
 
 
521 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  34.66 
 
 
917 aa  98.6  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  35.66 
 
 
870 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  35.66 
 
 
870 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  32.65 
 
 
1091 aa  97.8  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  34.25 
 
 
956 aa  97.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.54 
 
 
442 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  32.1 
 
 
1205 aa  96.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.69 
 
 
445 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  31.58 
 
 
1186 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  34.4 
 
 
897 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  34.31 
 
 
930 aa  93.2  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  33.06 
 
 
846 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  33.72 
 
 
881 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  32.05 
 
 
900 aa  90.5  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  32.71 
 
 
826 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  32.65 
 
 
846 aa  90.5  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  32.11 
 
 
891 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  30.8 
 
 
1088 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.32 
 
 
437 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  33.74 
 
 
851 aa  89.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  33.88 
 
 
855 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 
903 aa  88.6  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  32.44 
 
 
1085 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  36.41 
 
 
750 aa  88.2  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  33.88 
 
 
855 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  35.81 
 
 
896 aa  87.8  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  32.52 
 
 
887 aa  87.8  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  34.13 
 
 
922 aa  87  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  32.78 
 
 
860 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 
892 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1076  DNA mismatch repair protein MutS  31.6 
 
 
884 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  37.26 
 
 
918 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  34.41 
 
 
889 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3589  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 
885 aa  85.1  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  32.45 
 
 
870 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  33.47 
 
 
916 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  33.06 
 
 
855 aa  85.1  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  31.08 
 
 
881 aa  85.1  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  34.2 
 
 
1014 aa  85.5  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  33.47 
 
 
860 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  32.53 
 
 
898 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  30.87 
 
 
860 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  31.71 
 
 
903 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.18 
 
 
423 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  33.18 
 
 
968 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  34.38 
 
 
868 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  31.68 
 
 
916 aa  84  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  31.54 
 
 
882 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  31.78 
 
 
890 aa  83.6  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  32.41 
 
 
855 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40782  predicted protein  30.97 
 
 
1113 aa  82.8  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119207  normal  0.227387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  32.64 
 
 
855 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  31.1 
 
 
859 aa  82.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  33.97 
 
 
865 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  32.64 
 
 
859 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 
867 aa  82.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  33.74 
 
 
850 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  35.94 
 
 
868 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  32.49 
 
 
853 aa  82.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  31.71 
 
 
887 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  34.17 
 
 
862 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  30.36 
 
 
793 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  31.1 
 
 
871 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>