More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1604 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
460 aa  909    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.788637  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  37.81 
 
 
478 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  40.87 
 
 
478 aa  237  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  39.18 
 
 
479 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  38.29 
 
 
475 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.8 
 
 
457 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  39.68 
 
 
478 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  38.92 
 
 
478 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0644  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.82 
 
 
513 aa  231  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.340607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  34.48 
 
 
476 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.76 
 
 
511 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.43 
 
 
511 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.22 
 
 
517 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.22 
 
 
517 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.73 
 
 
513 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5539  NADH dehydrogenase subunit N  33.05 
 
 
506 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.758308  normal  0.475403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5411  NADH dehydrogenase subunit N  32.84 
 
 
506 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.23 
 
 
476 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.6 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2025  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.08 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.56 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  39.43 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5415  NADH dehydrogenase subunit N  33.26 
 
 
506 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4972  NADH dehydrogenase subunit N  33.54 
 
 
506 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.46 
 
 
482 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3291  NADH dehydrogenase subunit N  38.04 
 
 
492 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4991  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.39 
 
 
539 aa  219  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.11 
 
 
511 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  34.91 
 
 
484 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5088  NADH dehydrogenase subunit N  32.77 
 
 
506 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.48 
 
 
484 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5466  NADH dehydrogenase subunit N  33.05 
 
 
506 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0473  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.68 
 
 
505 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.428126  normal  0.230809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0971  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.26 
 
 
511 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.5 
 
 
487 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.94 
 
 
478 aa  216  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.19 
 
 
488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5140  NADH dehydrogenase subunit N  33.12 
 
 
506 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5532  NADH dehydrogenase subunit N  33.12 
 
 
506 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.14 
 
 
487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.82 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1476  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.34 
 
 
525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.217094  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.22 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.89 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5381  NADH dehydrogenase subunit N  32.7 
 
 
506 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000455286 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  37.83 
 
 
478 aa  213  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.29 
 
 
518 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  36.02 
 
 
481 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0190823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  37.83 
 
 
478 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  33.86 
 
 
480 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1767  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.14 
 
 
520 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.506609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  34.78 
 
 
481 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.05 
 
 
484 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  34.47 
 
 
481 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2153  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.62 
 
 
520 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.547893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3429  NADH dehydrogenase I, N subunit  37.59 
 
 
466 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.95 
 
 
482 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.54 
 
 
484 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1766  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37 
 
 
523 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0127704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  37.36 
 
 
485 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  32.18 
 
 
485 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  38.04 
 
 
489 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04321  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37 
 
 
523 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1369  NADH dehydrogenase I chain N  35.71 
 
 
457 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0931303  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  33.26 
 
 
489 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  38.68 
 
 
478 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2529  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  36.69 
 
 
526 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  33.93 
 
 
482 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  34.29 
 
 
492 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.16 
 
 
467 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.51 
 
 
511 aa  206  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  38.44 
 
 
487 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  38.44 
 
 
487 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  38.44 
 
 
487 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  32.26 
 
 
490 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  32.43 
 
 
485 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  32.26 
 
 
490 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  32.26 
 
 
490 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  32.26 
 
 
490 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  32.43 
 
 
485 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  32.43 
 
 
485 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  34.84 
 
 
485 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.84 
 
 
479 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  36.42 
 
 
485 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  34.59 
 
 
485 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  37.33 
 
 
487 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  36.31 
 
 
487 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  34.13 
 
 
488 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  35.36 
 
 
489 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04971  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.46 
 
 
506 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  34.13 
 
 
488 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2196  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  37.93 
 
 
520 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  37.23 
 
 
489 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  37.23 
 
 
489 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  34.59 
 
 
485 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  34.4 
 
 
489 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.09 
 
 
476 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  34.59 
 
 
485 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  34.59 
 
 
485 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  34.59 
 
 
485 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>