More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0260 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0260  Redoxin domain protein  100 
 
 
730 aa  1513    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00568025  normal  0.921803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0201  Redoxin domain protein  37.12 
 
 
368 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.54 
 
 
455 aa  73.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.83 
 
 
650 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4177  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
403 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  35.51 
 
 
447 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.78 
 
 
487 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.53 
 
 
393 aa  65.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.370556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.68 
 
 
175 aa  63.9  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  26.97 
 
 
198 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3943  redoxin domain-containing protein  27.56 
 
 
659 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.5 
 
 
288 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  36.11 
 
 
188 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  32.52 
 
 
174 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.49 
 
 
166 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  26.98 
 
 
403 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  26.98 
 
 
403 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.93 
 
 
178 aa  61.6  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  31.62 
 
 
185 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  31.62 
 
 
185 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  28.32 
 
 
172 aa  61.6  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  31.62 
 
 
185 aa  61.2  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.58 
 
 
424 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  27.66 
 
 
183 aa  60.8  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6146  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.5 
 
 
655 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000229834  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5034  Redoxin domain protein  26.12 
 
 
394 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3149  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.97 
 
 
504 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.03 
 
 
661 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0371216  normal  0.0467727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.9 
 
 
280 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0596  Redoxin domain protein  30.37 
 
 
173 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  26.88 
 
 
180 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  31.1 
 
 
171 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0377  periplasmic thioredoxin (cytochrome c biogenesis)  29.87 
 
 
198 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0463  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.94 
 
 
179 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6990  hypothetical protein  26.98 
 
 
371 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62876  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0365  periplasmic protein thiol  30.71 
 
 
197 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  26.61 
 
 
178 aa  58.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  24.44 
 
 
306 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3088  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  32.54 
 
 
199 aa  58.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  25.9 
 
 
306 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  31.15 
 
 
184 aa  58.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  25.9 
 
 
306 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.39 
 
 
169 aa  57.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2173  Redoxin domain protein  28.03 
 
 
336 aa  57.4  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  30.16 
 
 
211 aa  57.4  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1864  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.39 
 
 
386 aa  57.4  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0158194  normal  0.397812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
169 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.09 
 
 
174 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
179 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  30.28 
 
 
184 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0107  Redoxin domain protein  30.51 
 
 
455 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  35.85 
 
 
194 aa  56.2  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0413  periplasmic protein thiol  28.57 
 
 
197 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  31.94 
 
 
636 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0204  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  29.13 
 
 
198 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  38.36 
 
 
203 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.08 
 
 
175 aa  55.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1638  thioredoxin family protein  29.03 
 
 
328 aa  55.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.41 
 
 
178 aa  55.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.06 
 
 
201 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  29.93 
 
 
173 aa  55.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.9 
 
 
363 aa  55.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
184 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.95 
 
 
173 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0180  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  26.34 
 
 
195 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.06 
 
 
194 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  34.04 
 
 
188 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  26.84 
 
 
183 aa  55.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0709  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.03 
 
 
204 aa  54.7  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.704361  normal  0.894516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  25.88 
 
 
171 aa  55.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  31.19 
 
 
165 aa  54.7  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0844  putative lipoprotein thiredoxin  39.66 
 
 
185 aa  54.7  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  31.2 
 
 
174 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  23.15 
 
 
289 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  29.55 
 
 
277 aa  54.3  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.12 
 
 
191 aa  53.9  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0318  periplasmic protein thiol-disulfide oxidoreductase DsbE  27.27 
 
 
197 aa  53.9  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.55 
 
 
355 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  23.15 
 
 
289 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  27.56 
 
 
199 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  22.61 
 
 
332 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  22.61 
 
 
305 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  28.83 
 
 
176 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  30.22 
 
 
168 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0451  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.29 
 
 
179 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.03 
 
 
376 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  27.93 
 
 
182 aa  53.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1805  thiol-disulfide interchange protein  26.29 
 
 
179 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  31.93 
 
 
200 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.11 
 
 
228 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  31.03 
 
 
196 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2857  redoxin domain-containing protein  25.6 
 
 
168 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.526737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3991  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.67 
 
 
175 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03068  thiol:disulfide interchange protein dsbE (cytochrome c biogenesis protein ccmG)  24.34 
 
 
219 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.375687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1210  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  30.08 
 
 
177 aa  52.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  30.39 
 
 
180 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  25.62 
 
 
182 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  29.77 
 
 
174 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  31.06 
 
 
174 aa  52.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  40.68 
 
 
184 aa  52.8  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>