More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6135 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6135  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
121 aa  235  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29540  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  69.17 
 
 
126 aa  150  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.497056  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4134  ATP synthase F1, epsilon subunit  55.81 
 
 
129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1256  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.91 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2128  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.78 
 
 
130 aa  117  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000357189  hitchhiker  0.00501726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0381  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.42 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4327  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.58 
 
 
121 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  0.0303459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0901  ATP synthase F1 subunit epsilon  44.92 
 
 
133 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.20439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  53.77 
 
 
135 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2319  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.06 
 
 
121 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11338  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.48 
 
 
121 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1764  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.48 
 
 
133 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0654  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.49 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.70477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3875  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.5 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3861  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.5 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00697142  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.5 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00323652  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1837  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  50.59 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2406  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  54.81 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.385305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  56.63 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3915  ATP synthase F1, epsilon subunit  50 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0337  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.58 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08190  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  55.81 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  51.81 
 
 
94 aa  90.1  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1922  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.86 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1219  ATP synthase F1, epsilon subunit  48.96 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1025  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.57 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3706  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.85 
 
 
85 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10040  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  44.44 
 
 
93 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2604  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  47.67 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000410324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2337  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  46.51 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000264962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18170  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  47.06 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.316901 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.05 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.68 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2447  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  45.78 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.121306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  37 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.41 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.33 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.09 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4469  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.05 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0365154  normal  0.135413 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.05 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3021  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.66 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1271  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  46.99 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.472876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.66 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.58 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.94 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1308  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.3 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279861  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.55 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.54 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.98 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2172  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.6 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.81 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.35 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.86 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.66 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.86 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1773  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  47.89 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15581  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0522  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.508742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4485  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.19 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  hitchhiker  0.00000768605 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.92 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.25 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  34 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.49 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.21 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.58 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0503  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.34 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0445749  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.5 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.8 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.89 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.95 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.21 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.8 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.21 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.21 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.21 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.89 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.18 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.78 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  30.83 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.58 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.54 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.14 
 
 
138 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.92 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>