37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4993 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  53.31 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  45.83 
 
 		 353 aa  271  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  37.94 
 
 		 653 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  33.01 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  27.61 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  28.27 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  26.93 
 
 		 423 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  27.61 
 
 		 417 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  28.33 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  25.93 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  25.3 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  25.12 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  26.32 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  23.93 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  25.86 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1357 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  29.24 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  26.74 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  23.71 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  24.35 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  25.34 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  23.84 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  24.66 
 
 		 281 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  22.26 
 
 		 346 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1349 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  26.58 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  26.01 
 
 		 265 aa  46.2  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  24.49 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  24.3 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  23.68 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  22.82 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  23.63 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  25.29 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  27.95 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  22.49 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  25.4 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>