39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4801 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 256 aa  477  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  27.36 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.13 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  30.63 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  28.25 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  34.52 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  31.43 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  29.73 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  29.73 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  29.73 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  32.43 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  33.8 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  33.96 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  30.23 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  32.84 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0023  hypothetical protein  32.64 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.0202898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  30.34 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0595  hypothetical protein  36.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000906711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  31.58 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  31.71 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03240  uncharacterized membrane-associated protein  32.99 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.479554  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  30.66 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  30.66 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4294  SNARE associated Golgi protein  34.44 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  27.74 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  25 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4272  SNARE associated Golgi protein  34.44 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  32.83 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0417  membrane protein  33.63 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  25.66 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.754681  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  26.9 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  28.57 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3080  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000092136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  36.18 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  30.46 
 
 		 191 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.75 
 
 		 220 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>