45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3080 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3080  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000092136  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0023  hypothetical protein  50.28 
 
 
191 aa  167  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.0202898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1498  hypothetical protein  31.69 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000581479 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0595  hypothetical protein  35.44 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000906711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0417  membrane protein  32.18 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  33.04 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  33.04 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  33.04 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  29.03 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  28.23 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  28.23 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  28.71 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  27.42 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  27.42 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  27.42 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  27.42 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  25.81 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  25.81 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  28.68 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  28.68 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  28.68 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  28.68 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  28.68 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  28.71 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  26.63 
 
 
200 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  26.63 
 
 
200 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  28.68 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  28.68 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  25.44 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  27.93 
 
 
203 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  30.91 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4920  hypothetical protein  27.78 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  30.43 
 
 
203 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  30.43 
 
 
203 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1401  DedA family protein  27.75 
 
 
207 aa  44.7  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.5 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  29.91 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  27.93 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  28.77 
 
 
226 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  31.68 
 
 
224 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>