More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4599 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  100 
 
 
445 aa  884    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  56.82 
 
 
447 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  38.76 
 
 
1365 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  38.59 
 
 
482 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  40.77 
 
 
452 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  36.16 
 
 
1380 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  35.94 
 
 
1373 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  35.71 
 
 
1373 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  35.49 
 
 
1373 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  35.49 
 
 
1373 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  35.49 
 
 
1373 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  35.49 
 
 
1373 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  35.49 
 
 
1373 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  34.29 
 
 
459 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  37.56 
 
 
466 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  38.63 
 
 
452 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  34.83 
 
 
446 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  35.14 
 
 
457 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  39 
 
 
452 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  39.3 
 
 
445 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  34.17 
 
 
469 aa  242  9e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  35.8 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  36.63 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  32.44 
 
 
448 aa  234  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  33.48 
 
 
454 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  36.63 
 
 
474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  36.63 
 
 
474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  35.31 
 
 
444 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  35.75 
 
 
453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  33.85 
 
 
451 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  35.1 
 
 
431 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  32.52 
 
 
454 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  31.71 
 
 
447 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  32.56 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  33.93 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  34.71 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  41.28 
 
 
489 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  34.94 
 
 
465 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  35.84 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  34.51 
 
 
460 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  31.72 
 
 
445 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  36.36 
 
 
1053 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  33.82 
 
 
433 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  37.17 
 
 
525 aa  209  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  34.69 
 
 
457 aa  209  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  34.74 
 
 
461 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  35.96 
 
 
473 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  34.69 
 
 
446 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  37.71 
 
 
462 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  35.14 
 
 
471 aa  203  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  34.87 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  32.84 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  35.94 
 
 
1055 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  34.89 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  35.47 
 
 
479 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  38.38 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  35.46 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  33.63 
 
 
453 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  30.28 
 
 
448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  32.3 
 
 
459 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  36.36 
 
 
464 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  37.26 
 
 
470 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  34.66 
 
 
479 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  37.64 
 
 
466 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  37.64 
 
 
466 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  28.89 
 
 
453 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  37.29 
 
 
467 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  37.42 
 
 
474 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  34.35 
 
 
468 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  30.4 
 
 
495 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  30.4 
 
 
461 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  32.08 
 
 
462 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  29.8 
 
 
484 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  30.52 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  29.14 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  33.04 
 
 
437 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  29.14 
 
 
453 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  35.86 
 
 
478 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  33.73 
 
 
453 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  33.16 
 
 
460 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  33.77 
 
 
508 aa  186  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  34.83 
 
 
1075 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  31.55 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  34.65 
 
 
1079 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  33.25 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  34.65 
 
 
1079 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  34.33 
 
 
1064 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  32.81 
 
 
1065 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  33.42 
 
 
1065 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  32.81 
 
 
1065 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  29.09 
 
 
457 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  32.81 
 
 
1065 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  34.27 
 
 
1072 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  32.55 
 
 
1065 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  32.51 
 
 
462 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  32.55 
 
 
1065 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  32.55 
 
 
1065 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  32.55 
 
 
1065 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  32.55 
 
 
1065 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  32.55 
 
 
1006 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>