More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2328 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  100 
 
 		 363 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  45.51 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  49.16 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  46 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  45.3 
 
 		 381 aa  301  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0860  type III secretion exporter  46.99 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2008  type III secretion exporter  42.05 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2973  type III secretion exporter  42.09 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.01 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 		 362 aa  230  4e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.73 
 
 		 362 aa  225  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.74 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.75 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.16 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.74 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.98 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.08 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.48 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.4 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.72 
 
 		 350 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.34 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.44 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.61 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.67 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.94 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.74 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.44 
 
 		 380 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.24 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.16 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.46 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.16 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.71 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.71 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.16 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.49 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1522  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.59 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.22 
 
 		 383 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.48 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  35 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.75 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.83 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1698  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.62 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.64 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.28 
 
 		 377 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.36 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.19 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.25 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  37.6 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.6 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.64 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  37.6 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.02 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3772  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.75 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.67 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.32 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.15 
 
 		 377 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.19 
 
 		 357 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.67 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.89 
 
 		 386 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.51 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.84 
 
 		 377 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.73 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.16 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.36 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.02 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  38.76 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.61 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2603  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.78 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.25 
 
 		 377 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  35 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.68 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.29 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.26 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.55 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.26 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2826  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.51 
 
 		 354 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  0.270742 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.01 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.56 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.57 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  34 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.52 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.6 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  34 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.28 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.28 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>