35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2260 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  35.57 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  37.01 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  40.89 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  35.52 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  37.45 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.07 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  33.74 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  37.39 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  31.18 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  32.95 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  34.8 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  32.93 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  30.53 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  31.92 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  25.47 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  22.77 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  28.04 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.99 
 
 		 267 aa  48.5  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  25.71 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  27.34 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  24.11 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  29.55 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.55 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  31.3 
 
 		 289 aa  45.4  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.75 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  26.1 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3559  aminotransferase class IV  25.32 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.089993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  27.52 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  27.83 
 
 		 607 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  21.09 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  19.01 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2314  aminotransferase class IV  25.84 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5563  aminotransferase class IV  25.81 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>