30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1914 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1914  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 123 aa  237  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2957  UspA domain protein  45.28 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0210992  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  33.94 
 
 		 321 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1638  UspA domain protein  31.86 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170116  normal  0.0161914 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  37.97 
 
 		 302 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 296 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 289 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  33.93 
 
 		 343 aa  42  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  48.72 
 
 		 174 aa  42  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  31.58 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  57.14 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  48.84 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  53.85 
 
 		 323 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  55.88 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.11 
 
 		 294 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  55.56 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  54.76 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 296 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  33.64 
 
 		 303 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  33.01 
 
 		 274 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.58 
 
 		 285 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  37.72 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  52.63 
 
 		 283 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  33.03 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  51.43 
 
 		 381 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  34.85 
 
 		 282 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  33.65 
 
 		 271 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>