More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1360 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  100 
 
 
328 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  80.24 
 
 
331 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  73.56 
 
 
332 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  72.95 
 
 
332 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  72.34 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  72.62 
 
 
327 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  73.31 
 
 
337 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  72.64 
 
 
335 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  73.54 
 
 
338 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  71.73 
 
 
332 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  72.07 
 
 
333 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  72.09 
 
 
336 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  71.43 
 
 
332 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  70.12 
 
 
337 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  70.82 
 
 
334 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  71.43 
 
 
334 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  71.34 
 
 
336 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  69.39 
 
 
333 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  69.82 
 
 
336 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  69.42 
 
 
336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  69.85 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  70.9 
 
 
324 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  69.3 
 
 
335 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  65.97 
 
 
342 aa  460  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  68.18 
 
 
334 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  70.22 
 
 
321 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  66.47 
 
 
334 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  62.92 
 
 
329 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  65.75 
 
 
333 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  62.92 
 
 
329 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  55.14 
 
 
322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  52.53 
 
 
315 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  54.29 
 
 
315 aa  352  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  52.17 
 
 
316 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  51.72 
 
 
316 aa  322  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  47.32 
 
 
317 aa  315  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  50.94 
 
 
315 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  47.47 
 
 
310 aa  299  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  46.86 
 
 
314 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0086  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  50.31 
 
 
332 aa  285  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  46.23 
 
 
316 aa  285  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0838  aldo/keto reductase  47.2 
 
 
322 aa  280  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  45.74 
 
 
318 aa  269  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
319 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  42.72 
 
 
325 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  43.59 
 
 
317 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
319 aa  256  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
319 aa  256  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5864  aldo/keto reductase  43.2 
 
 
323 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  43.34 
 
 
329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2213  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2237  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2130  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
323 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940949  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5541  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2251  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  44.65 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1962  aldo/keto reductase  44.17 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.575618  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3157  putative voltage-gated potassium channel, beta subunit  43.83 
 
 
323 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1064  aldo/keto reductase  42.3 
 
 
323 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680696  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0875  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.93 
 
 
323 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.73472  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.93 
 
 
323 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0919  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.93 
 
 
323 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146678  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1917  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.93 
 
 
323 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00610  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  42.51 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.576143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.95 
 
 
332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0600  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.93 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0504  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.93 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2039  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.06 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
327 aa  232  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03480  Voltage-gated potassium channel beta-2 subunit, putative  41.16 
 
 
355 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0255  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.27 
 
 
330 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
325 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  39.04 
 
 
327 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
323 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21730  Oxidoreductase aldo/keto reductase family  41.82 
 
 
347 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  40.68 
 
 
339 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
331 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0880  aldo/keto reductase  41.44 
 
 
347 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
339 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08597  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  42.22 
 
 
341 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.51 
 
 
331 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1721  aldo/keto reductase  42.48 
 
 
342 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0463  aldo/keto reductase  40.84 
 
 
348 aa  222  7e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0252  aldo/keto reductase  40.57 
 
 
345 aa  221  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2091  aldo/keto reductase  40.57 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649423  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  40.56 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  38.63 
 
 
340 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4823  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
350 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2293  oxidoreductase  41.58 
 
 
360 aa  219  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0207177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0082  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
347 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  41.48 
 
 
326 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1455  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.138581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
309 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0355  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
347 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
336 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>