62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1009 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  100 
 
 
151 aa  300  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3850  Mov34/MPN/PAD-1  79.56 
 
 
137 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3836  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  79.56 
 
 
137 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.818865  normal  0.112998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3924  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  79.56 
 
 
137 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  77.37 
 
 
137 aa  225  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1965  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  78.2 
 
 
135 aa  219  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  77.78 
 
 
135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  70 
 
 
152 aa  215  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  75.91 
 
 
137 aa  214  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4293  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  80.29 
 
 
137 aa  213  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  73.72 
 
 
137 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  74.07 
 
 
141 aa  209  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1725  Mov34/MPN/PAD-1  74.81 
 
 
138 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  76.69 
 
 
144 aa  204  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0989  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  72.06 
 
 
162 aa  203  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  74.63 
 
 
134 aa  202  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  72.39 
 
 
148 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  71.32 
 
 
162 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  69.34 
 
 
137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.91 
 
 
136 aa  196  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1539  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  76.86 
 
 
145 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  70.15 
 
 
148 aa  187  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  67.42 
 
 
157 aa  176  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  64.62 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  54.74 
 
 
159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  40.91 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.57 
 
 
138 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  36.3 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.59 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.57 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.12 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.56 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  30.15 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.09 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.09 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.59 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.89 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.55 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.74 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.59 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  30.23 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.4 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.43 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.93 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.77 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.6 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.54 
 
 
139 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.1 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.51 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.14 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.35 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.35 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  24.29 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  30.95 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.41 
 
 
158 aa  43.9  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.25 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  28.77 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  29.84 
 
 
264 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  30.51 
 
 
143 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  28.79 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  29.01 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  26.85 
 
 
236 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>