168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0857 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  43.4 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  39.53 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.04 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  38.84 
 
 
324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.25 
 
 
319 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  34.11 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.71 
 
 
358 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  32.81 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  33.64 
 
 
353 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  33.48 
 
 
319 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.75 
 
 
331 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  32 
 
 
259 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  36.16 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  30.48 
 
 
266 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  34.12 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.48 
 
 
517 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.23 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.78 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.92 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  27.6 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  27.6 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.6 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  31.71 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.86 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  28.69 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.82 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  29.68 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  30.8 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  29.91 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.67 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.19 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.26 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.19 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.08 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  28.85 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  28.91 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  30.67 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.73 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  26.61 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.09 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.39 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  31.36 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.55 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  30.05 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  27.04 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.43 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.18 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.02 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.58 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.68 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  29.15 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.9 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.86 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.86 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  28.77 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.11 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  28.29 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  28.77 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  28.11 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.76 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  28.77 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  28.77 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.11 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.11 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.44 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.06 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.11 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  30.94 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.89 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.47 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  27.65 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.65 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  27.65 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.53 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  27.65 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  27.65 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.9 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.65 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  27.65 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.38 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  26.32 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.94 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  27.62 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  31.19 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.22 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  30.74 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  29.46 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.37 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.64 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.11 
 
 
281 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  27.19 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.19 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.84 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  26.85 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  27.19 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.78 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>